2024年6月19日,由深圳國家基因庫、華大生命科學(xué)研究院、國際數(shù)據(jù)委員會共同發(fā)起,華大基因和華大智造主辦的2024『猛犸杯』國際生命科學(xué)數(shù)據(jù)創(chuàng)新大賽-歐洲·算法賽(2024??MICOS-EU)決賽在塞爾維亞貝爾格萊德順利舉辦。
經(jīng)過初賽、復(fù)賽的嚴(yán)格評審篩選,6支隊伍從100多個參賽團(tuán)隊中脫穎而出進(jìn)入最后決戰(zhàn)。經(jīng)過激烈角逐決出最終結(jié)果:來自蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的“Curious”團(tuán)隊榮獲一等獎, 另外5支來自University of Belgrade、IDATA、University of Kragujevac、SynBio AI??Lab和重慶科技大學(xué) 等機構(gòu)的團(tuán)隊分別榮獲二、三等獎和優(yōu)秀獎。
上圖:冠軍頒獎
2024??MICOS-EU聚焦科研熱點時空組,旨在有效解決空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)聚類算法的準(zhǔn)確性和效率問題。自今年4月正式啟動以來,共吸引來自中國、瑞士、塞爾維亞、新加坡、丹麥、西班牙等國家和地區(qū)的100余支團(tuán)隊參與。
6月19日,2024??MICOS-EU決賽與貝爾格萊德生物信息學(xué)會議(BelBi2024)在塞爾維亞貝爾格萊德同期舉行。貝爾格萊德大學(xué)、塞爾維亞分子遺傳學(xué)與基因工程研究所、Ana??and Vlade Divac Foundation和華大教育中心等機構(gòu)的專家作為嘉賓/評委蒞臨現(xiàn)場參與本次決賽。
晉級團(tuán)隊? 終極PK
2024??MICOS-EU決賽于6月19日順利舉行,華大生命科學(xué)研究院院長徐訊以線上視頻的形式為本次決賽致辭。徐訊院長表示:“我們很高興將MICOS帶到歐洲,這是MICOS大賽的一個重要里程碑。 ??期待決賽中創(chuàng)新算法的涌現(xiàn),為空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)處理提供突破性解決方案,進(jìn)一步推動多組學(xué)數(shù)據(jù)研究的進(jìn)步!”
在答辯環(huán)節(jié),進(jìn)入決賽的6支團(tuán)隊分別對各自的算法/模型展開精彩介紹。每支參賽團(tuán)隊陳述結(jié)束后,評委專家進(jìn)行提問,隨后從算法/模型創(chuàng)新性、架構(gòu)設(shè)計、復(fù)雜度以及答辯過程的PPT陳述、邏輯性等方面進(jìn)行評分。
本次大賽的最終評分由線上得分和答辯得分兩部分組成,按二者加權(quán)后的最終得分進(jìn)行排名。經(jīng)過激烈的角逐,本次大賽的結(jié)果正式揭曉:
冠軍團(tuán)隊開發(fā)的AESTETIK算法為空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究產(chǎn)生的海量多模態(tài)數(shù)據(jù)中的聚類問題提供了卓越的解決方案,尤其是在解決異質(zhì)細(xì)胞群癌癥組織研究等精準(zhǔn)醫(yī)療挑戰(zhàn)中表現(xiàn)出色。
AESTETIK是一種卷積深度學(xué)習(xí)模型算法,整合了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究涉及的多種數(shù)據(jù)類型:轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、空間位置、組織形態(tài)等,并基于10x??Genomics、NanoString、Stereo-seq等多個技術(shù)平臺產(chǎn)生的數(shù)據(jù)集進(jìn)行性能優(yōu)化和提升,在下游分析任務(wù)中取得了優(yōu)異的成績,性能和效果遠(yuǎn)超其他已知算法。
上圖:決賽現(xiàn)場
至此2024 MICOS-EU圓滿收官。作為MICOS大賽的首個海外賽道,2024??MICOS-EU獲獎的6支優(yōu)秀參賽團(tuán)隊根據(jù)時空轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集分析任務(wù)目標(biāo),提出了6種不同的聚類算法思路并進(jìn)行了改進(jìn),為時空組多模態(tài)數(shù)據(jù)分析提供突破性解決方案。
2024 MICOS-EU賽事組織機構(gòu)
發(fā)起單位: 深圳國家基因庫、華大生命科學(xué)研究院、國際數(shù)據(jù)委員會
主辦單位: 華大基因、華大智造
協(xié)辦單位: 貝爾格萊德大學(xué)電氣工程學(xué)院、塞爾維亞分子遺傳學(xué)與基因工程研究所
贊助單位: 華訊網(wǎng)絡(luò)、深圳市藍(lán)色億點科技有限公司
*大賽組委會保留對本次大賽的最終解釋權(quán)。
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